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生物化学常考的名词解释 [复制链接]

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离线心远
 
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只看楼主 正序阅读 使用道具 0楼 发表于: 2008-12-05
生物化学名词结实大全
《生物化学》清华大学出版社!
第一章
1,氨基酸(amino acid):是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有
机化合物,氨基一般连在α-碳上。
2,必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎动物)
(赖氨酸,苏氨酸等)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基
酸。
3,非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎
动物)自己能由简单的前体合成
不需要从食物中获得的氨基酸。
4,等电点(pI,isoelectric point):使分子处于兼性分子状态,在电
场中不迁移(分子的静电荷为零)的pH值。
5,茚三酮反应(ninhydrin reaction):在加热条件下,氨基酸或肽
与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。
6,肽键(peptide bond):一个氨基酸的羧基与另一个的氨基的氨基
缩合,除去一分子水形成的酰氨键。
7,肽(peptide):两个或两个以上氨基通过肽键共价连接形成的聚
合物。
8,蛋白质一级结构(primary structure):指蛋白质中共价连接的
氨基酸残基的排列顺序。
9,层析(chromatography):按照在移动相和固定相 (可以是气体
或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。
10,离子交换层析(ion-exchange column)使用带有固定的带电基
团的聚合树脂或凝胶层析柱
11,透析(dialysis):通过小分子经过半透膜扩散到水(或缓冲
液)的原理,将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。
12,凝胶过滤层析(gel filtration chromatography):也叫做分子
排阻层析。一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质
或其它分子混合物的层析技术。
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13,亲合层析(affinity chromatograph):利用共价连接有特异配
体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质
或其它分子的层析技术。
14,高压液相层析(HPLC):使用颗粒极细的介质,在高压下分离
蛋白质或其他分子混合物的层析技术。
15,凝胶电泳(gel electrophoresis):以凝胶为介质,在电场作用
下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。
16,SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE):在去污剂十二烷基硫
酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳。SDS-PAGE只是按照分子的大
小,而不是根据分子所带的电荷大小分离的。
17,等电聚胶电泳(IFE):利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)
在聚丙烯酰氨凝胶制造一个pH梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它
的等电点(pI)处,即梯度足的某一pH时,就不再带有净的正或负
电荷了。
18,双向电泳(two-dimensional electrophorese):等电聚胶电泳
和SDS-PAGE的组合,即先进行等电聚胶电泳(按照pI)分离,然后
再进行SDS-PAGE(按照分子大小分离)。经染色得到的电泳图是二
维分布的蛋白质图。
19,Edman降解(Edman degradation):从多肽链游离的N末端测
定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修
饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽
链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。
20,同源蛋白质(homologous protein):来自不同种类生物的序列
和功能类似的蛋白质,例如血红蛋白。
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月岛 鲜花 +1 2008-12-05
微微 鲜花 +1 2008-12-05
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只看该作者 26楼 发表于: 2009-04-16
收了
离线落魄狂生
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只看该作者 25楼 发表于: 2009-04-15
lz辛苦啦~
离线liuhaiyan
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只看该作者 24楼 发表于: 2009-03-17
很好,辛苦了
离线荆棘青蛙
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只看该作者 23楼 发表于: 2009-03-13
真是不错,可惜不是上个学期拿出来的
离线liuhaiyan
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只看该作者 22楼 发表于: 2009-03-13
太好了
离线死鱼

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只看该作者 21楼 发表于: 2008-12-05
很热心的楼主啊
离线bigman
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只看该作者 20楼 发表于: 2008-12-05
最近流行这个?
离线心远
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只看该作者 19楼 发表于: 2008-12-05
第二十章
1,转录因子(transcription factor):在转录起始复合物的组装过程
中,与起动子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质。某些转
录因子在RNA延伸时一直维持着结合状态。
2,操纵子(operon):是由一个或多个相关基因以及调控他们转录
的操纵因子启动子序列组成的基因表达单位。
3,操纵因子(operator):与特定阻遏蛋白相互作用调控一个基因
或一组基因表达的DNA区。
4,结构基因(structural gene):编码一个蛋白质或一个RNA的基
因。
5,转录激剂(transcriptional activator):通过曾加RNA聚合酶的活
性来加快转录速度的一种调节DNA结合蛋白。
6,阻遏物(repressor):与一个基因的调控序列或操纵基因结合以
阻止该基因恩录的一类蛋白质。
7,衰减作用(attenuation):一种翻译调控机制。在该机制中,核
糖体沿着mRNA分子的移动的速度决定转录是进行还是终止。
8,亮氨酸拉链(leucine zipper):出现地DNA结合蛋白质和其它蛋
白质中的一种结构基元(motif)。当来自同一个或不同多肽链的两
个两用性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸残基)相互作用形成
一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。
9,锌脂(zinc fingre):也是一种常出现在DNA结合蛋白中的一种
结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个
Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2构成,形成的结构像手指状。
(中国生物论坛 www.biooo.com copyright reserved)
离线心远
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只看该作者 18楼 发表于: 2008-12-05
第十九章
1,翻译(translation):在蛋白质合成期间,将存在于mRNA上代表
一个多肽的核苷酸残基序列转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。
2,遗传密码(genetic code):核酸中的核苷酸残基序列与蛋白质

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中的氨基酸残基序列之间的对应关系。;连续的3个核苷酸残基序列
为一个密码子,特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由64个密码子
组成的,几乎为所有生物通用。
3,起始密码子(iniation codon):指定蛋白质合成起始位点的密码
子。最常见的起始密码子是蛋氨酸密码:AUG
4,终止密码子(termination codon):任何tRNA分子都不能正常识
别的,但可被特殊的蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上释
放的密码子。存在三个终止密码子:UAG ,UAA和UGA。
5,密码子(condon):mRNA(或DNA)上的三联体核苷酸残基序
列,该序列编码着一个指定的氨基酸 ,tRNA 的反密码子与mRNA的
密码子互补。
6,反密码子(anticodon):tRNA分子的反密码子环上的三联体核
苷酸残基序列。在翻译期间,反密码子与mRNA中的互补密码子结
合。
7,简并密码子(degenerate codon):也称为同义密码子。是指编
码相同的氨基酸的几个不同的密码子。
8,氨基酸臂(amino arm):也称为接纳茎。tRNA分子中靠近3ˊ
端的核苷酸序列和5ˊ端的序列碱基配对,形成的可接收氨基酸的臂
(茎)。
9,TψC臂(TψC arm):tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核
苷酸-胞嘧啶核苷酸残基序列的茎-环结构。
10,氨酰-tRNA(aminoacyl-tRNA):在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸
残基共价连接了氨基酸的tRNA分子。
11,同工tRNA(isoacceptor tRNA):结合相同氨基酸的不同的
tRNA分子。
12,摆动(wobble):处于密码子3ˊ端的碱基与之互补的反密码子
5ˊ端的碱基(也称为摆动位置),例如I可以与密码子上3ˊ端的
U,C和A配对。由于存在摆动现象,所以使得一个tRNA反密码子可
以和一个以上的mRAN密码子结合。
13,氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase):催化特定氨
基酸激活并共介结合在相应的tRNA分子3ˊ端的酶。
14,翻译起始复合物(translation initiation complex):由核糖体亚
基,一个mRNA模板,一个起始的tRNA分子和起始因子组成并组装
在蛋白质合成起始点的复合物。
15,读码框(reading frame):代表一个氨基酸序列的mRNA分子
的非重叠密码序列。一个mRNA读码框是由转录起始位置(通常是
AUG密码)确定的。
16,SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用于结合原核
生物核糖体的序列。
17,肽酰转移酶(peptidy transeferace):蛋白质合成期间负责转
移肽酰基和催化肽键形成的酶。
18,嘌吟毒素(puromycin):通过整合到生长着的肽链,引起肽链
合成提前终止来抵制多肽名链合成的一种抗生素。
19,开放读码框(open reading frame):DNA或RNA序列中一段不
含终止密码的连续的非重叠核苷酸密码。
20信号肽(signal peptide):常指新合成多肽链中用于指导蛋白质
夸膜转移(定位)的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端)。
离线心远
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只看该作者 17楼 发表于: 2008-12-05
第十八章
1,遗传学中心法则(genetic central dogma):描述从一个基因到
相应蛋白质的信息流的途径。遗传信息贮存在DNA中,DNA被复制传
给子代细胞,信息被拷贝或由DNA转录成RNA,然后RNA翻译成多
肽。不过,由于逆转录酶的反应,也可以以RNA为模板合成DNA。
2,转录(transcription):在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复
合物的催化下,从双链DNA分子中拷贝生物信息生成一条RNA链的过
程。
3,模板链(template strand):可作为模板转录为RNA的那条链该
链与转录的RNA碱基互补(A-U,G-C)。在转录过程中,RNA聚合酶
与模板链结合,并沿着模板链的3'→5'方向移动,按照5'→3'
方向催化RNA的合成。
4,编码链(coding strand):双链DNA中,不能进行转录的那一条
DNA链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在RNA中
是以U取代了DNA中的T)。
5,核心酶(core enzyme):大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基
组成(α2β,βδ),没有δ基的酶叫核心酶。核心酶只能使已开
始合成的RNA链延长,但不具有起始合成RNA的能力,必须加入δ基
才表现出全部聚合酶的活性。
6,RNA聚合酶(RNA polymerase):以一条DNA链或RNA为模板催化
由核苷-5'-三磷酸合成RNA的酶。
7,启动子(promoter):在DNA分子中,RNA聚合酶能够结合并导
致转录起始的序列。
8,内含子(intron):在转录后的加工中,从最初的转录产物除去
的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA外显子的DNA中
的区域。
9,外显子(exon):既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的
RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA内含子的
DNA中的区域。
10,终止因子(termination factor):协助RNA聚合酶识别终止信号
的的辅助因子(蛋白质)。
11,核酶(ribozyme):具有像酶那样催化功能的RNA分子。
12,剪接体(spliceosome):大的蛋白质—RNA复合体,它催化内含
子从mRNA前体中除去的反应。
13,RNA加工过程(RNA processing):将一个RNA原初转录产物转
换成成熟RNA分子的反应过程。加工包括从原初产物中删除一些核苷
酸,添加一些基因没有编码的核苷酸和对那些碱基进行共介修饰。
14,RNA剪接(RNA splicing):从DNA模板链转录出的最初转录产
物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过
程。
离线心远
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只看该作者 16楼 发表于: 2008-12-05
第十七章
1,半保留复制(semiconservative replication):DNA复制的一种方
式。每条链都可用作合成互补链的模板,合成出两分子的双链DNA,
每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成。
2,复制叉(replication fork):Y字型结构,在复制叉处作为模板的
双链DNA解旋,同是合成新的DNA链。
3,DNA聚合酶(DNA polymerase):以DNA为模板,催化核苷酸残
基加到已存在的聚核苷酸3ˊ末端反应的酶。某些DNA聚全酶具有外
切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核苷酸的序列。
4,Klenow片段(Klenow fragment):E.coli DNA聚合酶I经部分水
解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶I的
5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切
酶活性。
5,前导链(leading strand):与复制叉移动的方向一致,通过连续
的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。
6,滞后链(lagging strand):与复制叉移动的方向相反,通过不连
续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。
7,冈崎片段(Okazaki fragment):相对比较短的DNA链(大约
1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片
段,这是Reiji Okazaki在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前
体观察到的。
8,引发体(primosome):一种多蛋白复合体,E.coli中的引发体包
括催化DNA滞后链不连续DNA合成所必需的,短的RNA引物合成的引
发酶,解旋酶。
9,复制体(replisome):一种多蛋白复合体,包含DNA聚合酶,引
发酶,解旋酶,单链结合蛋白和其它辅助因子。复制体位于每个复
制叉处进行细菌染色体DNA复制的聚合反应。
10,单链结合蛋白(SSB):一种与单链DNA结合紧密的蛋白,它的
结构可以防止复制叉处单链DNA本身重新折叠回双链区。
11,滚环复制(rolling-circle replication):复制环状DNA的一种模
式,在该模式中,DNA聚合酶结合在一个缺口链的3ˊ端绕环合成与
模板链互补的DNA,每一轮都是新合成的DNA取代前一轮合成的
DNA。
12,逆转录酶(reverse transcriptase):一种催化以RNA为模板合
成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指导的DNA合成,水解RNA和DNA指
导的DNA合成的酶活性。
13,互补NDA(cDNA):通过逆转录酶由mRNA模板合成的双链
DNA。
14,聚合酶链式反应(PCR):扩增样品中的DNA量和富集众多DNA
分子中的一个特定的DNA序列的一种技术。在该反应中,使用与目的
DNA序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮的DNA合成。其中包括
DNA变性,引物退火和在Tap DNA聚合酶催化下的DNA合成。
15,直接修复(direct repair):是通过一种可连续扫描DNA,识别
出损伤部位的蛋白质,将损伤部位直接修复的方法。该修复方法不
用切断DNA或切除碱基。
16切除修复(excision repair):通过切除-修复内切酶使DNA损伤消
除的修复方法。一般是切除损伤区,然后在DNA聚合酶的作用下,以
露出的单链为模板合成新的互补链,最后用连接酶将缺口连接起
来。
17,错配修复(mismatch repair):在含有错配碱基的DNA分子
中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式。这种修复方式的过程是:
识别出下正确地链,切除掉不正确链的部分,然后通过DNA聚合酶和
DNA连接酶的作用,合成正确配对的双链DNA。
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只看该作者 15楼 发表于: 2008-12-05
第十六章
1,激素(hormone):一类由内分泌器官合成的微量的化学物质,
它由血液运输到靶组织起着信使的作用,调节靶组织(或器官)的
功能。
2,激素受体(hormone receptor):位于细胞表面或细胞内,结合
特异激素并引发细胞响应的蛋白质。
3,第二信使(second messenger):响应外部信号(第一信使),
例如激素,而在细胞内合成的效应分子,例如cAMP,肌醇三磷酸或
二酰基甘油等。第二信使再去调节靶酶,引起细胞内各种效应。
4,级联放大(cascade amplification):在体内的不同部位,通过一
系列酶的酶促反应来传递一个信息,并且初始信息在传递到系列反
应的最后时,信号得到放大,这样的一个系列叫作级联系统。
5,G蛋白(G protein):地细胞内信号传导途径中起着重要作用的
GTP结合蛋白,由α,β,γ三个不同亚基组成。激素与激素受体结
合诱导GTP跟G蛋白结合的GDP进行交换结果激活位于信号传导途径
中下游的腺苷酸环化酶。G蛋白将细胞外的第一信使肾上腺素等激素
和细胞内的腺苷酸环化酶催化的腺苷酸环化生成的第二信使cAMP联
系起来。G蛋白具有内源GTP酶活性。
6,激素效应元件(HER):指内固醇甲状腺素等激素受体结合的一
段短的DNA序列(12~20bp),这类受体结合DNA后可改变相邻基因
的表达。
离线心远
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只看该作者 14楼 发表于: 2008-12-05
第十五章
1,核苷酸磷酸化酶(nucloside phosphoryalse):能分解核苷生成
含氮碱和戊糖的磷酸酯的酶。
2,核苷水解酶(nucloside hydrolase):能分解核苷生成含氮碱和
戊糖的酶。
3,从头合成(de novo synthesis):生物体内用简单的前体物质合
成生物分子的途径,例如核苷酸的从头合成。
4,补救途径(salvage pathway):与从头合成途径不同,生物分
子,例如核苷酸,可以由该类分子降解形成的中间代谢物,如碱基
等来合成,该途径是一个再循环途径。
5,痛风(gout):是尿酸过量生产或尿酸排泻不充分引起的尿酸堆积
造成的,尿酸结晶堆积在软骨,软组织,肾脏以及关节处。在关节
处的沉积会造成剧烈的疼痛。
6,别嘌呤醇(allopurinol):是结构上烦恼于黄嘌呤的化合物(在
嘌呤环上第七位是C,第八位是N),对黄嘌呤氧化酶有很强的抑制
作用,常用来治疗痛风。
7,自杀抑制作用(suicide substrate):底物烦恼物经酶催化生成的
产物变成了该酶的抑制剂,例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制就
属于这种类型。
8,Lesch-Nyhan综合症(Lesch-Nyhan syndrome):也称为自毁容
貌症,是由于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶的遗传缺陷引起的。
缺乏该酶使得次黄嘌呤和鸟嘌呤不能转换为IMP和GMP,而是降解为
尿酸,过量尿酸将导致Lesch-Nyhan综合症。
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只看该作者 13楼 发表于: 2008-12-05
第十四章
氨基酸的代谢
1,生物固氮作用(biological nitrogen fixatio):大气中的氮被原还
为氨的过程。生物固氮只发生在少数的细菌和藻类中。
2,尿素循环(urea cycle):是一个由4步酶促反应组成的,可以将
来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的循环。讠循环是发生在脊椎动
物的肝脏中的一个代谢循环。
3,脱氨(deamination):在酶的催化下从生物分子(氨基酸或核
苷酸)中除去氨基的过程。
4,氧化脱氨(oxidative deamination):α-氨基酸在酶的催化下脱
氨生成相应的α-酮酸的过程。氧化脱氨实际上包括氧化和脱氨两个
步骤。(脱氨和水解)
5,转氨(transamination):一个α-氨基酸的α-氨基借助转氨酶的
催化作用转移到一个α-酮酸的过程。
6,乒乓反应(ping-pong reaction):在该反应中,酶结合一个底物
并释放一个产物,留下一个取代酶,然后该取代酶再结合第二个底
物和释放出第二个产物,最后酶恢复到它的起始状态。
7,生糖氨基酸(glucongenic amino acid):降解可生成能作为糖异
生前体的分子,例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。
8,生酮氨基酸(acetonegenic amino acid):降解可生成乙酰CoA
或酮体的氨侉酸。
9,苯酮尿症(phenylketonuria):是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引起
苯丙酸堆积的代谢遗传病。缺乏丙酮酸羟化酶,苯丙氨酸只能靠转
氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆积对神
经有毒害,使智力发肓出现障碍。
10,尿黑酸症(alcaptonuria):是酪氨酸代谢中缺乏尿黑酸酶引起
的代谢遗传病。这种病人的尿中含有尿黑酸,在碱性条件下暴露于
氧气中,氧化并聚合为类似于黑色素的物质,从而使尿成黑色。
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